針對莫拉克颱風來襲，釀成巨災，全國禱告網絡協會表示，上帝對臺灣復興的心意已更加在顯明中，南台灣當前的情況，是教會需要敏銳上帝的心意，起來火熱、迫切禱告，並付出實質關懷行動的時刻。
　禱告網絡呼籲，要特別為災後可能發生的疫情及人心健康守望。禱告網絡指出，基督徒要起來禱告，懇求神智慧啟示的靈大大運行在人心，除去煩悶、沮喪的心情，使災民的心可以被安慰，不被惡者誘發憂鬱症等心理疾病；南部的大雨會將土壤中的病菌沖刷出來，引發民眾感染事件，因此特別要禱告抵擋這樣的情況，讓受災民眾經過提醒就更加注意身體保健；身體顧好，心情也才不會低落。其次，禱告政府相關救助單位，能將救災物資妥善分配、快速有效且公平地發放到災民手中，使得指責人的指頭或惡言的拉扯消弭於無形。還有，禱告眾教會，齊力同心展開救災和持續關懷行動，見證阿爸天父的憐憫與慈愛，突破惡者各樣謊言和毀壞的工作，不容讓惡者竊奪父神的榮耀。