台灣的教育環境一直以來偏重升學制度，養出許多有術無德、缺乏獨立思考能力的下一代，到近來吵得沸沸揚揚的多元成家法案、性別平等教育修法、《青春水漾》影片等事件，讓極多父母相當憂心孩子們被學校錯植性解放的荒唐價值觀，愈多加深思考「在家教育」的可能性。

「中華基督教慕真在家教育協會」前身為跨縣市、跨宗派的7個基督徒家庭組成的在家教育團契，成立一年多後，加入的會員家庭快速成長到100多個，看見需要甚大之際，也面臨人力、資源不足的考驗，團隊禱告尋求神後，有感動應繼續做下去，2000年正式向內政部成立協會。